大約于100年前（1892~1895年），德國(guó)Robert Koch的學(xué)生Richard Pfeiffer在研究霍亂弧菌感染的發(fā)病機(jī)理時(shí)，發(fā)現(xiàn)該菌可產(chǎn)生兩種具有不同性質(zhì)的毒性物質(zhì)，一種為由活菌合成并釋放出來(lái)，對(duì)熱敏感的蛋白質(zhì)成分即外毒素（exotoxin），另一種為對(duì)熱抵抗，并且只有當(dāng)細(xì)菌崩解后才能釋放出來(lái)的非蛋白質(zhì)成分，他將后一種毒性物質(zhì)稱為內(nèi)毒素（endotoxin）。

緊接著，意大利的Engenio Centanni通過(guò)自溶的方法從各種革蘭氏陰性桿菌中提取到了類似的毒性物質(zhì)，他稱其為致熱毒素（pyrotoxina），因?yàn)檫@類物質(zhì)在表達(dá)毒性的同時(shí)始終亦表達(dá)顯著的發(fā)熱反應(yīng)活性。

同時(shí)期，德國(guó)的Hans Buchner證實(shí)從多種細(xì)菌提取得到的內(nèi)毒素物質(zhì)除引起發(fā)熱外，可引起白細(xì)胞數(shù)目的改變，并可顯著增強(qiáng)機(jī)體對(duì)細(xì)菌感染的抵抗力，從而Buchner開創(chuàng)了“非特異性療法"或“發(fā)熱療法"。

紐約的外科醫(yī)師William B. Coley將加熱殺死的靈桿菌和化膿性鏈球菌上清濾液應(yīng)用于各種惡性腫瘤（特別是肉瘤）的治療，并取得了較為滿意的療效。他將其應(yīng)用的細(xì)菌上清液稱為Coley氏毒素。繼后，Murray J. Shear證實(shí)Coley氏毒素中發(fā)揮抗腫瘤作用的物質(zhì)為內(nèi)毒素。

但是，內(nèi)毒素化學(xué)本質(zhì)的闡明是到了50年代后才開始的。德國(guó)的Otto westphal和Otto Liederitz首先介紹了提取高純度內(nèi)毒素的方法一一酚水法，使得內(nèi)毒素的化學(xué)和結(jié)構(gòu)分析成為可能，從而開創(chuàng)了內(nèi)毒素化學(xué)和內(nèi)毒素分子生物學(xué)研究的新時(shí)代。